Отдел занимается разработкой кибернетических систем управления сложными биотехническими объектами (молочными фермами, птицефабриками, зернообрабатывающими предприятиями, пчеловодческими хозяйствами и др.) с корректируемой целью управления на многолетнем интервале времени путем адаптации структуры машинных технологий и автоматизированных систем управления предприятием (АСУП) к изменяющимся внешним условиям.

Отдел  автоматизации  организован  в 1989г, зав. отделом д.т.н.,  профессор Р.М.Славин, с 1998г —   д.т.н., профессор  В.Р.Краусп.

В  настоящее время в отдел входят  следующие лаборатории:

В разное время в отделе  функционировали  лаборатории  электрификации и  автоматизации  птицеводства, электрификации водоснабжения, роботизированных систем в АПК, нанотехнологий.  Каждая лаборатория выполняла  свой тематический план. Работа по общей проблеме  для всего отдела начата с 2010г

 Фото сотрудников отдела